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软件目录

• Slurm使用帮助
  • sbatch
    • 一个简单的例子
    • 除此之外，还有一些常见的参数
    • 一个GPU作业的例子
    • 一个批量并行作业的例子
    • 一个跨节点多核心的例子
  • salloc
    • 一个简单的例子
    • 一个GPU节点的例子
    • 一个跨节点使用案例
  • sinfo
    • 通过sinfo查看所有分区的占用状态
    • 通过sinfo查看指定分区的空闲状态
    • sinfo的一些常用参数
  • squeue
    • 显示队列中所有的作业squeue
    • 在队列中显示自己的作业
    • 按照自己的格式要求显示队列信息
    • squeue的常见参数
  • sacct
    • 通过scontrol show job显示作业信息
    • 通过sacct显示作业信息
    • 通过sacct按照指定格式输出作业信息
  • scancel
    • 取消指定作业
    • 取消自己上机上号上所有作业
    • 取消自己上机账号上所有状态为PENDING的作业
    • scancel常见参数
• Module使用帮助
  • module常见的一些指令
  • 查看可用模块
  • 加载模块
  • 卸载模块
  • 特别说明
  • 编写modulefile来管理自己的软件环境
• Conda使用帮助
  • 安装conda
  • 使用conda创建虚拟环境，并在虚拟环境中安装软件
  • 例子：用conda创建python的虚拟环境
  • 例子：用conda创建R语言运行环境
  • 例子：用conda管理perl语言环境
  • 例子：用conda安装生信软件
  • 错误处理
• Singularity使用帮助
  • 在拥有root权限的个人主机上安装Singularity
  • 使用Singularity部署软件镜像，以软件molspin为例
• Pytorch
  • 安装
  • 使用与提交作业
• Screen
  • Screen基本使用
• Tmux
  • 安装
  • 使用