salloc

申请计算节点，然后登录到申请到的计算节点上运行指令

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一个简单的例子

• 申请一个计算节点6个核心，运行时间为2小时，并跳转到该节点上运行程序

  salloc -p compute -N 1 -n 1 -c 6 -t 2:00:00
  # salloc 申请成功后会返回申请到的节点和作业ID等信息，假设申请到的是c02节点，作业ID为1078858。如无法获取节点信息，请执行命令squeue进行查询。
  ssh c02      # 直接登录到刚刚申请到的节点c02调式作业
  scancel 1078858   # 计算资源使用完后取消作业
  squeue -j 1078858 # 查看作业是否还在运行，确保作业已经退出，避免产生不必要的费用
  

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一个GPU节点的例子

• 申请一个gpu节点，16个核心，1块GPU卡，运行时间为2天，并跳转到节点上运行程序

  salloc -p gpu -N 1 -n 1 -c 16 --gres=gpu:1 -t 2-00:00:00
  # 假设申请成功后返回的作业号为1078859，申请到的节点是g05。如无法获取节点信息，请执行命令squeue进行查询。
  ssh g05 # 登录到gpu05上调式作业
  scancel 1078859  # 计算资源使用完后取消作业
  squeue -j 1078859 # 查看作业是否还在运行，确保作业已经退出，避免产生不必要的费用
  

• 注意： 由于GPU节点上的GPU卡是共享的，所以在申请GPU节点时，需要指定GPU卡的数量，否则会报错

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一个跨节点使用案例

• 申请两个大内存节点，每个节点12个核心，运行时间为6小时20分钟

  salloc -p big -N 2 -n 12 -t 6:20:00
  # salloc 申请成功后会返回申请到的节点和作业ID等信息，假设申请到的是b[05-06]节点，作业ID为1078857。如无法获取节点信息，请执行命令squeue进行查询。
  # 这里申请两个节点，每个节点12个进程，每个进程一个核心
  
  # 根据需求导入MPI环境
  module load openmpi4/4.1.1
  module load mvapich2/2.3.6
  
  # 根据以下命令生成MPI需要的machine file
  srun hostname -s | sort -n > slurm.hosts
  
  mpirun -np 24 -machinefile slurm.hosts hostname
  
  scancel 1078857  # 计算资源使用完后取消作业
  squeue -j 1078857 # 查看作业是否还在运行，确保作业已经退出，避免产生不必要的费用
  

• 注意： 由于MPI的运行机制，需要在申请节点时指定每个节点的进程数，否则会报错